2019-nCoV刺突蛋白中的独特插入片段与HIV-1 gp120和Gag的异常相似性

作者:Prashant Pradhan, Ashutosh Kumar Pandey, Akhilesh Mishra, Parul Gupta, Praveen Kumar Tripathi, Manoj Balakrishna Menon, James Gomes, Perumal Vivekanandan, Bishwajit Kundu
原文:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927871v1
原文全文:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927871v1.full.pdf
翻译:Abacus Chinese Translation Services

摘要:我们目前正在目睹由2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的主要流行病。 2019-nCoV的发展仍然难以捉摸。 我们在刺突糖蛋白(S)中发现了4个插入片段,这是2019-nCoV所独有的,其在其他冠状病毒中并不存在。 重要的是,所有4个插入片段中的氨基酸残基均与HIV-1 gp120或HIV-1 Gag中的氨基酸残基具有相同性或相似性。 有趣的是,尽管插入片段在一级氨基酸序列上是不连续的,但2019-nCoV的3D建模表明它们会聚在一起构成受体结合位点。 在2019-nCoV中发现4个独特的插入片段,这些插入片段都与HIV-1关键结构蛋白中的氨基酸残基具有同一性/相似性。这在自然界不太可能是偶然的。 这项工作提供了关于2019-nCoV的未知见解,并阐明了该病毒的进化和致病性,对诊断该病毒具有重要意义。

之后有专家评论:此4个插入片段并不只是存在于HIV病毒中,而在其他冠状病毒中也有存在。因此,此篇文章具有误导性。此篇文章之后被撤回。
但随后,一位曾获得诺贝尔奖的法国科学家得到了同样的结论,并猜测印度实验结果的撤回有可能是受到了来自某些方面的压力。

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